Луижи Рикарди 1 , Роза Мацзео 2,*©, Анжело Раffaele Marcotrigiano 1 , Гуглельмо Райнальди 3 , Паоло Иовьено 4 , Вито Зонно 1 , Стефано Паван 1© болон Концетта Лотти 2,*
- 1 Хөрс, ургамал, хүнсний шинжлэх ухааны тэнхим, Ургамлын генетик, үржлийн нэгжийн Бари их сургуулийн Виа Амендола 165/А, 70125 Бари, Итали; luigi.ricciardi@uniba.it (LR);angelo.marcotrigiano@uniba.it (ARM); vito.zonno@uniba.it (VZ); stefano.pavan@uniba.it (SP)
- 2 Фоггиагийн их сургуулийн Хөдөө аж ахуй, хүнс, хүрээлэн буй орчны шинжлэх ухааны тэнхим, Виа Наполи 25, 71122 Foggia, Итали
- 3 Баригийн Их Сургуулийн Био шинжлэх ухаан, биотехнологи, био эмийн тэнхим, Виа Орабона 4, 70125 Бари, Итали; guglielmo.rainaldi@uniba.it
- 4 ENEA Trisaia судалгааны төв, SS 106 Ionica, 419+500 км, 75026 Rotondella (MT), Итали, Эрчим хүчний технологийн хэлтэс, биоэнерги, био боловсруулах үйлдвэр, ногоон химийн хэлтэс; paolo.iovieno@enea.it
* Захидал: rosa.mazzeo@unifg.it (RM); concetta.lotti@unifg.it (CL)
Товч танилцуулга:
Сонгино (Allium cepa L.) нь дэлхий даяар хоёр дахь чухал хүнсний ногооны ургац бөгөөд эрүүл мэндэд тустай гэдгээрээ алдартай. Сонгино нь эдийн засгийн чухал ач холбогдолтой, функциональ хоол хүнс болох үнэ цэнийг үл харгалзан генетикийн олон янз байдлын талаар муу судлагдсан байдаг. Эндээс бид Бари (Италийн өмнөд хэсэг, Апулиа) мужийн нэгэн жижиг хотод олон зуун жилийн түүхтэй газар нутаг болох "Acquaviva red onion" (ARO)-ийн генетикийн өөрчлөлтийг судалсан. 11 ARO популяци, арилжааны гурван нийтлэг төрлөөс бүрдсэн үр хөврөлийн цуглуулгад генетикийн өөрчлөлтийг судлахын тулд 13 микро хиймэл дагуулын маркерыг ашигласан. Параметрийн болон параметрийн бус аргуудын тусламжтайгаар генетикийн бүтцэд хийсэн дүн шинжилгээ нь ARO нь ихэвчлэн андуурдаг Тропеа, Монторо газрын язгууруудаас тодорхой ялгаатай, сайн тодорхойлсон генийн санг төлөөлдөг болохыг онцолсон. Ихэвчлэн шинэхэн хэрэглээнд ашигладаг булцууны тодорхойлолтыг өгөхийн тулд уусдаг хатуу агууламж ба хурц чанарыг үнэлж, дээр дурьдсан хоёр газрын арьстай харьцуулахад ARO-д илүү амттай болохыг харуулсан. Ерөнхийдөө энэхүү судалгаа нь арилжааны луйврыг хязгаарлаж, жижиг аж ахуйн нэгжүүдийн орлогыг нэмэгдүүлэхэд хувь нэмрээ оруулах чанарын шошгооор дамжуулан сурталчлах боломжтой ARO-ийн ирээдүйн үнэлгээнд ашигтай юм.
Оршил
Allium төрөлд 750 орчим зүйл багтдаг [1], тэдгээрийн дотор сонгино (Allium cepa L., 2n = 2x =16) хамгийн өргөн тархсан зүйлийн нэг юм. A. cepa нь хоёр жилийн мөчлөгтэй бөгөөд нөхөн үржихүйн зан үйлийг давж гардаг. Өнөө үед сонгины дэлхийн үйлдвэрлэл (97.9 Mt) нь улаан лоолийн дараа хоёр дахь чухал хүнсний ногооны ургац болж байна [2]. Эрт дээр үеэс сонгины булцууг хоол хүнс болон ардын эмчилгээнд хэрэглэж ирсэн. Үнэхээр ч эртний египетчүүд МЭӨ 1550 оны эмнэлгийн папирус буюу Codex Ebers [3]-д сармис, сонгино хэрэглэхэд үндэслэсэн эмчилгээний хэд хэдэн жорыг аль хэдийн мэдээлсэн байдаг.
Энэхүү олон талт, эрүүл ногоог түүхий, шинэхэн эсвэл боловсруулсан бүтээгдэхүүн болгон хэрэглэж, олон аяга тавагны амтыг сайжруулахад ашигладаг. Сүүлийн үеийн хэд хэдэн судалгаагаар сонгины хэрэглээ нь зүрх судасны өвчин [4,5], таргалалт [6], чихрийн шижин [7], хорт хавдрын янз бүрийн хэлбэрийн [8-10] эрсдлийг бууруулдаг болохыг баталж байна. Сонгины эрүүл мэндийн шинж чанар нь флавоноид ба алк(эн)ил цистеины сульфоксид (ACSOs) гэсэн хоёр төрлийн тэжээлийн нэгдлүүдийн өндөр агууламжтай холбоотой байдаг. Эхний ангилалд флавонол ба антоцианин орно. Кверцетин нь чөлөөт радикалуудыг устгах, шилжилтийн металлын ионуудыг холбох хүчтэй антиоксидант, үрэвслийн эсрэг шинж чанараараа алдартай флавонол юм. [11]; Харин антоцианин нь зарим сонгины сортуудад улаан/ягаан өнгө өгдөг. ACSO-ийн хувьд хамгийн элбэг байдаг нь изоаллиин [(+)-транс-S-1-пропенил-L-цистеины сульфоксид] [12]Сонгины хурц үнэр, амтыг шууд бусаар хариуцдаг эсэд хадгалагддаг ууршдаггүй, уураггүй хүхрийн амин хүчил. [13]. Эд эс задрах үед изоаллиин нь аллииназа ферментээр задарч, хэд хэдэн дэгдэмхий нэгдлүүдийг (пируват, аммиак, тиосульфонат ба пропанетиал S-оксид) үүсгэдэг бөгөөд энэ нь нулимсыг өдөөж, эвгүй үнэр (хурц) үүсгэдэг. [14]. Сонгины хурц чанарыг ихэвчлэн шинэ жингийн грамм тутамд гидролизийн үр дүнд үүссэн пирувийн хүчлийн хэмжээгээр хэмждэг. [15,16].
Газар дундын тэнгисийн сав газрын орнуудад олон янз байдлын хоёрдогч төвүүдийн нэг болох санал болгосон. A. cepa [17,18], сонгины булцуу нь хэлбэр, хэмжээ, өнгө, хуурай бодис, хурц чанараараа маш олон янз байдаг [19-22]. Түүнчлэн хүхэрт суурилсан бордоо, агротехникийн арга барил, хөрсний төрөл, цаг уурын нөхцөл, сорт, газар нутгийн генотип нь өвөрмөц органолептик болон тэжээллэг чанарыг өгөх замаар булцууны чанарт нөлөөлдөг. [23-27]. Италид сонгины үр хөврөл өргөн тархсан хэдий ч цөөн хэдэн сонгины сортууд нь ихэвчлэн шинжлэх ухааны судалгаанд хамрагдаж, зохих шинж чанартай байдаг. [28,29].
Агробиологийн төрөл зүйлийн генетик болон фенотипийн шинж чанарыг нарийвчлан тогтоох нь ургамлын генетик нөөцийг зохих ёсоор хамгаалах, нэмүү өртгийн сүлжээнд тодорхой генотипийн хэрэглээг дэмжихэд маш чухал юм. [30-32]. Энгийн дарааллын давталт (SSR) тэмдэглэгээг зураглал хийхдээ ихэвчлэн сонгосон байдаг [33-35], ДНХ-ийн хурууны хээ болон сорт ялгах [36-38], мөн газар нутгийн доторх болон тэдгээрийн хоорондын генетикийн хэлбэлзлийн найдвартай тооцоо [39-42], учир нь тэдгээр нь локусын өвөрмөц, олон аллел, кодоминантаар удамшдаг, нөхөн үржих чадвар өндөр, автоматжуулсан генотип хийхэд тохиромжтой.
Энэхүү судалгаанд бид Бари мужийн Аквавива делле Фонти хотын жижиг талбайд органик тариалангийн аргаар тариалж буй Апуличуудын уламжлалт газар нутаг болох “Acquaviva red onion” (ARO) дээр анхаарлаа төвлөрүүлэв. (Италийн өмнөд хэсэг, Апулия). Энэ газрын булцуу нь том, хавтгай, улаан өнгөтэй бөгөөд орон нутгийн жоронд ихэвчлэн ашиглагддаг. ARO нь "Удаан хоолны тэргүүлэгч" чанарын тэмдгийг авсан хэдий ч үйлдвэрлэлийг хамгаалагдсан газарзүйн заалт (PGI) болон хамгаалагдсан гарал үүслийн тэмдэглэгээ (POD) зэрэг Европын Холбооны чанарын тэмдэгээр улам дэмжиж, хамгаалж болох юм. арилжааны залилан мэхлэх, жижиг аж ахуйн нэгжүүдийн орлогыг сайжруулах. Энд SSR молекулын маркеруудыг ARO популяцийн генетикийн өөрчлөлтийг үнэлэх хүчирхэг хэрэгсэл болгон ашиглаж, энэ газрын үүлдэрийг Италийн бусад хоёр улаан сонгиноос ялгах зорилгоор ашигласан. Цаашилбал, бид ARO-ийн амтыг зах зээлийн эрэлт хэрэгцээтэй уялдуулан үнэлэхийн тулд хурц болон уусдаг хатуу агууламжийг тооцоолсон.
үр дүн
Acquaviva улаан сонгины үр хөврөлийн цуглуулга, морфологийн шинж чанарыг бий болгох
BiodiverSO Апулия бүсийн төслийн хүрээнд тариаланчдын хандивласан АХБХ-ны 13 популяцийн үрийг ARO үр хөврөлийн цуглуулгыг бий болгоход ашигласан.
Булцуу, арьс, махтай холбоотой морфологийн тодорхойлогчдыг ARO үр хөврөл болон гурван сонгины язгуураас цуглуулсан бөгөөд тэдгээрийн хоёр нь "Tropea red onion" (TRO), нэг нь "Montoro copper onion" (MCO) газрын язгуурт (Зураг) 1). ARO-ийн бүх булцуу нь хавтгай байсан бөгөөд гаднах улаан арьс, улаан өнгийн янз бүрийн сүүдэртэй махаар тодорхойлогддог. Үүний эсрэгээр, TRO булцууны мах бүрэн улаан өнгөтэй байсан бол MCO чийдэнгийн мах нь пигмент муутай байсан (Хүснэгт S1). Биохимийн шинжилгээ нь хатуу уусдаг агууламж, хурц чанарыг үнэлэх боломжийг олгосон. Хүснэгтэнд мэдээлснээр 1, ARO популяци дахь булцууны хатуу уусдаг агууламжийн дундаж утга 7.60 байсан ба 6.00 (ARO12) -аас 9.50° Brix (ARO11 ба ARO13) хооронд хэлбэлзэж байв. Энэ утга нь TRO болон MCO газрын гадаргын хувьд тооцоолсон хэмжээнээс өндөр байв (тус тус бүр 4.25 ба 6.00 ° Brix).
Хүснэгт 1. “Acquaviva Red Onion” (ARO), “Tropea Red Onion” (TRO), “Montoro Copper Onion” (MCO) популяциудад үнэлэгдсэн хатуу уусдаг агууламж ба хурц чанарын утгууд *.
Код | Уусдаг хатуу агууламж (Брикс) | Хурц (pмолг-1 FW) | ||
Дундаж утга | CV y (%) | Дундаж утга | CV y (%) | |
ARO1 | 6.25 D * | 5.65 | 5.84 ab * | 23.78 |
ARO2 | 7.25 DC | 4.87 | 6.51 a | 22.98 |
ARO3 | МЭӨ 7.50 | 9.42 | 5.28 он | 22.88 |
ARO4 | МЭӨ 7.50 | 0.00 | 6.97 a | 3.74 |
ARO 5 | МЭӨ 7.50 | 0.00 | 6.80 a | 9.68 |
ARO6 | 6.25 D | 5.65 | 4.51 он | 39.18 |
ARO7 | 7.25 DC | 4.87 | 5.25 он | 15.44 |
ARO8 | 9.00 AB | 0.00 | 7.04 a | 3.49 |
ARO9 | 8.25 ABC | 4.28 | 6.84 a | 0.15 |
ARO10 | 7.00 DC | 0.00 | 5.94 он | 6.57 |
ARO11 | 9.50 нь | 7.44 | 5.54 он | 16.43 |
ARO12 | 6.00 D | 0.00 | 4.91 он | 9.70 |
ARO13 | 9.50 нь | 7.44 | 6.63 a | 24.93 |
MCO | 6.00 D | 0.00 | 4.18 он | 2.66 |
TRO1 | 4.25 E | 8.31 | 2.80 б | 2.10 |
TRO2 | 4.25 E | 8.31 | 4.28 он | 4.79 |
* Том эсвэл жижиг үсгээр бичсэн ижил үсгүүд нь 0.01P эсвэл 0.05P-д статистикийн хувьд ялгаатай биш (SNK-ийн тест). y Өөрчлөлтийн коэффициент.
Пирувийн хүчлийн агууламжаар үнэлэгдсэн ARO хурц байдлын дундаж утга нь 6.00, 4.51 pmol г хооронд хэлбэлзэж байв.-1 FW (ARO6) -аас 7.04 (ARO8). Энэ утга нь TRO болон MCO газрын гадаргын тооцоолсон хэмжээнээс өндөр байсан (3.54 pmol g-1 FW ба 4.18 pmol g-1 FW, тус тус).
SSR полиморфизм ба элсэлтийн хоорондох генетикийн харилцаа
Энэхүү судалгаанд туршиж үзсэн 11 SSR праймерын хослолын 37 нь нэг локустай полиморфизм, өөрөөр хэлбэл нэг хүнд хамгийн ихдээ хоёр олшруулалтын бүтээгдэхүүнийг өгдөг. Нийтдээ 55 хүнд 320 аллель илэрсэн бөгөөд нэг байршилд 2 (ACM147 ба ACM 504)-ээс 11 (ACM132) хооронд хэлбэлзэж, 5 аллелийн дундаж утга (Хүснэгт) байна. 2). Хувь хүний популяцид аллелийн тоо (Na) 1.94 (ACM147 ба ACM504)-аас 5.38 (ACM132) хооронд хэлбэлздэг бол аллелийн үр дүнтэй тоо (Ne) 1.41 (ACM152) -аас 2.82 (ACM449) хооронд хэлбэлздэг. Зөрчил Na болон Ne-ийн хоорондох утгууд нь популяцид бага давтамжтай аллель байгаа бөгөөд зөвхөн цөөн тооны аллель давамгайлж байсантай холбоотой юм. Хамгийн их ажиглагдсан гетерозигот байдлын (Ho) утгыг ACM138 ба ACM449 (0.62) дээр тодруулсан бол хамгийн бага нь ACM152 (0.25)-тай холбоотой байв. Панмикозын популяцийн онолын хүлээлттэй тохирч буй хүлээгдэж буй гетерозигот байдал (He) нь 0.37 (ACM504)-аас 0.61 (ACM132, ACM138, ACM449) хооронд хэлбэлзэж байв. Райтын бэхэлгээний индекс (Fis) нь бүх тэмдэглэгээний хувьд тэгтэй ойролцоо утгыг (дунджаар 0.05) харуулсан бөгөөд энэ нь давж гарсан зүйлийн хувьд ажиглагдсан болон хүлээгдэж буй гетерозигот байдлын түвшин хоорондын ижил утгыг харуулж байна. Генетикийн хурууны хээ авахдаа SSR маркерын үр ашгийг полиморф мэдээллийн агуулгын (PIC) индексээр үнэлж, дундаж утга нь 0.48 ба 0.33 (ACM504) - 0.67 (ACM132) хооронд хэлбэлзэж байна. Өөр нэг үр ашгийн индекс болох Шенноны мэдээллийн индекс (I) нь 0.84 дундаж утгыг харуулсан бөгөөд 0.45 (ACM152) -аас 1.20 (ACM132) хооронд хэлбэлзэж байна.
Хүснэгт 2. ARO, TRO, MCO популяцийн генетикийн олон янз байдлыг тооцоолоход ашигладаг 11 SSR маркерын полиморфизмын онцлогууд. Нийт аллелийн тоо (Na), зурвасын хэмжээ, полиморф мэдээллийн агуулгын (PIC) индекс Энэ судалгаанд генотиплэгдсэн 320 бодгалийн нийт багцыг үзнэ үү. Аллелийн тоо (Na), үр дүнтэй аллелийн тоо (Ne), ажиглагдсан гетерозигот байдал (Ho), хүлээгдэж буй гетерозигот байдал (He), бэхэлгээний индекс (F)is), Шэннон мэдээллийн индекс (I) нь тус бүр 16 хүнээс бүрдсэн 20 популяциас тооцсон дундаж утгыг илэрхийлнэ.
Locus. | Нийт На | Хэмжээний хүрээ (bp) | PIC | Дундаж утга | |||||
Na | Ne | Ho | He | I | Fis | ||||
ACM91 | 4 | 189-205 | 0.40 | 2.63 | 1.72 | 0.38 | 0.39 | 0.66 | 0.04 |
ACM101 | 4 | 229-241 | 0.52 | 2.94 | 2.37 | 0.53 | 0.56 | 0.92 | 0.06 |
ACM132 | 11 | 186-248 | 0.67 | 5.38 | 2.78 | 0.55 | 0.61 | 1.20 | 0.09 |
ACM138 | 5 | 242-272 | 0.66 | 3.69 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.09 | -0.02 |
ACM147 | 2 | 264-266 | 0.37 | 1.94 | 1.83 | 0.44 | 0.44 | 0.62 | -0.01 |
ACM152 | 4 | 228-244 | 0.25 | 2.38 | 1.41 | 0.25 | 0.27 | 0.45 | 0.07 |
ACM235 | 4 | 286-298 | 0.41 | 2.81 | 1.77 | 0.44 | 0.41 | 0.72 | -0.06 |
ACM446 | 6 | 108-120 | 0.56 | 3.50 | 2.48 | 0.49 | 0.58 | 1.01 | 0.16 |
ACM449 | 8 | 120-140 | 0.66 | 4.88 | 2.82 | 0.62 | 0.61 | 1.18 | -0.03 |
ACM463 | 5 | 202-210 | 0.47 | 3.38 | 1.95 | 0.46 | 0.48 | 0.83 | 0.05 |
ACM504 | 2 | 188-192 | 0.33 | 1.94 | 1.64 | 0.30 | 0.37 | 0.54 | 0.20 |
Дундаж утга | 5 | 0.48 | 3.22 | 2.15 | 0.46 | 0.48 | 0.84 | 0.05 |
Популяцийн дунд ARO3, ARO6, ARO8, ARO10, TRO1, MCO нь генетикийн өндөр түвшний өөрчлөлтийг (Ho > 0.5) харуулсан бол хамгийн бага олон янз байдал нь популяцид ARO7 (Ho = 0.27) ажиглагдсан (Нэмэлт хүснэгт S2). Ерөнхийдөө бүх нэмэлтүүд F-г харуулсанis тэгтэй ойролцоо утгууд (Fis дундаж утга = 0.054), санамсаргүй хосолсон нөхцөлд хүлээгдэж буй.
Молекулын хэлбэлзэл ба генетикийн бүтцийн шинжилгээ
Популяци хоорондын болон популяци доторх генетикийн өөрчлөлтийн шаталсан хуваалтыг AMOVA тооцоолсон. Үр дүн нь популяци дахь генетикийн өөрчлөлтийн нэлээд хэсгийг (87%) онцолсон. Хүн амын ялгаа, 13% нь маш чухал байсан (P < 0.001) (Хүснэгт 3). 0.002 (ARO2/ARO10)-аас 0.468 (ARO7/TRO2) хүртэлх Wright-ийн Fst бэхэлгээний индексийн ижил төстэй Fpt параметрийн хос утгууд нь чухал байсан (P < 0.05), есөн хос харьцуулалтыг эс тооцвол (Нэмэлт хүснэгт S3).
Хүснэгт 3. 320 популяциас 16 генотипийн молекулын дисперсийн шинжилгээ allium cepa L.
Эх сурвалж | df | Талбайн нийлбэр | Зөрчлийн тооцоо | Өөрчлөлт (%) | Fpt | P |
Хүн амын дунд | 15 | 458.63 | 1.16 | 13% | ||
Хүн амын дотор | 304 | 2272.99 | 7.50 | 87% | 0.134 | 0.001 |
Нийт | 319 | 2731.62 | 8.66 |
Генетикийн бүтцийг судлах A. cepa Энэхүү судалгаанд генотипжүүлсэн цуглуулгыг програм хангамжийн БҮТЭЦ-д хэрэгжүүлсэн хольцын загварт суурилсан кластерын шинжилгээгээр гүйцэтгэсэн. Эванногийн АК арга нь хоёр кластерт (K = 2) хуваахыг санал болгосон бөгөөд бидний хувьд хамгийн мэдээлэл сайтай. мэдээллийн сан,-тай хамтe ирэх хамгийн өндөр peak at K = 5 (Нэмэлт Rgure S1). A К-ийн хувьд = 2, aморины хүчтэйopүндэслэлүүд wилжигigned оnболонf хоёр кластер хамтран a rnernbertoip коэффициент (q) > 0.7. Сhown in Зураг 2a, эхний кластер (S1 нэртэй) нь ММБ болон бүх ARO популяцийг багтаасан бол S2 кластер нь TRO хоёр популяцийг бүлэглэсэн. K = 5-д өгөгдлийн багцын дэлгэрэнгүй тайлбарыг өгнө (Зураг 2b), элсэлтийн 75% нь таван кластерын аль нэгэнд хуваарилагдсан. ARO (S1) ба TRO (S2) хоёрын хоорондох ялгаа батлагдсан боловч зарим ARO популяци холилдсон (q < 0.7) эсвэл S3 ба S4 (ARO7 ба ARO12 тус тус) хоёр шинэ кластерт тус тусад нь бүлэглэгдсэн. Сонирхолтой нь, МСБ-ын арилжааны төрөл нь Апулианы улаан сонгиноос тусгаарлагдсан тодорхой кластер (S5) үүсгэсэн.
Популяци хоорондын генетикийн харилцаа
SSR полиморфизм нь генетикийн олон янз байдлын дендрограммыг зурах боломжийг олгосон бөгөөд филогенетик шинжилгээний үр дүнг Зураг дээр үзүүлэв. 3a. Энд үр хөврөлийн цуглуулгыг bootstrap утгуудаар хүчтэй дэмжсэн таван бүлэгт хуваасан. ARO7 ба ARO12 популяцийг үлдсэн популяциас нэн даруй салгаж, хоёр өөр кластер үүсгэв. Гурав дахь кластер нь TRO-ийн арилжааны хоёр популяцийг багтаасан бол дөрөв дэх зангилаа нь MCO-г арван нэгэн ARO популяциас хуваадаг. Популяци хоорондын генетикийн хамаарлыг үндсэн координатын шинжилгээ (PCoA) ашиглан цаашид судалсан (Зураг 3b). Өмнө дурьдсанчлан, ARO-ийн популяцийг PCoA-д тусгаарлагдсан байрлалд гарч ирсэн ARO12 ба ARO7-аас бусад нь нягт бүлэглэсэн. Хоёр TRO болон MCO популяци нь талбайн баруун доод хэсэгт тархсан байв.
Зураг 3. 16 дунд генетикийн олон янз байдал A. cepa SSR профайлд үндэслэн энэхүү судалгаанд тодорхойлогдсон популяци. (a) Удамшлын зайн UPGMA дендрограмм. Bootstrap-ийн дэмжлэгийн утгуудыг >50 харгалзах зангилааны дээр заасан; (b) үндсэн бүрэлдэхүүн хэсгүүдийн шинжилгээ (PCoA). Улаан өнгөөр дугуйлсан кластер нь филогенетикийн шинжилгээгээр үүсгэгдсэн бүлэгтэй бүрэн таарч, 11 ARO нэгдлээс бүрдсэн.
хэлэлцүүлэг
Италийн өмнөд хэсэгт уламжлалт байдлаар тариалж буй их хэмжээний агро-биологийн төрөл зүйлийн дотор сонгины газар нутаг нь удамшлын элэгдэл, орчин үеийн сортоор солигдох аюулаас хамгаалах шаардлагатай бүтээгдэхүүн юм. Нутгийн өвтэй нягт холбоотой Апули мужийн генетик нөөцийг цуглуулах, тодорхойлох, сурталчлах, хамгаалах зорилготой BiodiverSO бүсийн төслийн хүрээнд бид ARO газрын 13 популяциас бүрдсэн үрийн цуглуулгыг байгуулсан. ДНХ-ийн полиморфизм, уусдаг хатуу ба пирувийн хүчлийн агууламж, амт шинж чанартай холбоотой, шинэхэн болоогүй бүтээгдэхүүнийг хүлээн авахад чухал ач холбогдолтой биохимийн хоёр параметрийн хувьд ARO-ийн өөрчлөлтийн анхны үнэлгээг бид мэдээлсэн. Нэмж дурдахад, ARO газрын үүлдрийн талаархи мэдээллийг ихэвчлэн андуурдаг өөр хоёр пигменттэй сонгины газрын цуглуулсан мэдээлэлтэй харьцуулсан.
Амтат сонгины үйлдвэрлэлийн удирдамжийн дагуу биохимийн шинжилгээ нь 13 ARO популяцийн амтлаг чанарыг онцолсон бөгөөд энэ нь уусдаг хатуу агууламж өндөр, дунд зэргийн хурц чанартай холбоотой юм. [31]. ARO чийдэн нь TRO болон MCO газрын үүлдрийнхээс илүү амттай байсан бөгөөд бага зэрэг өндөр хурц тод байдлыг харуулсан. Гэсэн хэдий ч сонгино дахь чихэрлэг байдал нь чихрийн агууламж ба хурц чанар хоёрын тэнцвэртэй холбоотой байдаг тул энэхүү шинж чанар нь зөвхөн морфологи дээр үндэслэн фермерүүдийн үнэ цэнэтэй генотипийг сонгоход тустай байж болох юм.
SSR маркерууд нь Аквавива делле Фонти хот гэх мэт нарийхан ургадаг бүс нутагт цуглуулсан ч генотипийг ялгах ашигтай хэрэгсэл болох нь батлагдсан. Сонгосон маркерууд нь өмнө нь мэдээлсэн маркеруудаас илүү олон тооны аллелийг харуулсан [43] болон [44], гэхдээ мэдээлсэн тэмдэглэгээнээс доогуур байна [45]. Түүнчлэн, манай багцын 50% нь PIC индексийн утгыг 0.5-аас дээш харуулсан нь цуглуулгад байгаа популяцийг ялгахад тохиромжтой болохыг нотолсон. [46]. Популяци дахь олон янз байдлын үнэлгээ нь Хо ба Хэ хоёрын хооронд ижил төстэй утгыг илрүүлж, Fi багатай болсонs үнэт зүйлс. Энэ нь хөндлөн огтлолцох шинж чанартай тохирч байна A. cepa, цус ойртолтын сэтгэл гутралд ноцтойгоор нэрвэгддэг [47]. Нийт Fis Энэ судалгаанд авч үзсэн сонгины популяцид тооцсон үнэ цэнэ (0.054) нь өмнө нь мэдээлсэнээс бага байсан. [45] (0.22) бөгөөд олсонтой бараг ижил байна [31] (0.08) болон [48] (0.00) тэд баруун хойд Испани, Нигерийн сонгины язгуурын генетикийн олон янз байдлыг үнэлэв. ARO популяци дахь гетерозигот байдлын анхаарал татахуйц түвшин Апулия нь цэцэрлэгжүүлэлтийн олон зүйлийн олон янз байдлын төвийг төлөөлдөг гэсэн ойлголтыг бататгаж байна. [32, 42, 49-51].
Энэхүү судалгаанд генотиплэгдсэн цуглуулгын ихэнх молекулын өөрчлөлт нь популяцид оршдог гэдгийг AMOVA онцолсон. Гэсэн хэдий ч популяцийн генетикийн мэдэгдэхүйц ялгаа (ФPT үнэ цэнэ) нь генетикийн давхаргажилтын илрэлийг илрүүлсэн. Үнэн хэрэгтээ бидний үр дүнгээс харахад ихэнх ARO популяцид генетикийн нэгдмэл байдал байгаа нь сайн тодорхойлогдсон кластер үүсгэсэн боловч ARO7 болон ARO12 популяци нь тодорхой генетикийн дүр төрхийг харуулсан. Энэ үр дүн нь популяцийг цуглуулсан хоёр фермерийн ашигласан үрийн гарал үүслийн өөр байсантай холбоотой байж болох юм. Түүгээр ч зогсохгүй, олж авсан үр дүнд үндэслэн ARO газрын язгуур нь генийн түвшинд TRO болон MCO газрын язгууруудаас тодорхой ялгаатай гэж үзэж болно. Сүүлийн үеийн судалгаагаар, [29] "Acquaviva", "Tropea", "Montoro" зэрэг Италийн хэд хэдэн сонгины үүлдрийн генетикийн олон янз байдлыг үнэлэв. Хэдийгээр зохиогчид сонгины цуглуулгын генетикийн олон янз байдлыг үнэлэхийн тулд SNP маркерыг ашигласан ч генотип нь "Acquaviva" -г "Tropea" болон "Montoro" сонгиноос ялгаж салгаж чадаагүй юм. Магадгүй, энэ зөрүү нь PIC-ийн дундаж утга бага (0.292) олдсонтой холбоотой байж болох бөгөөд энэ нь дүн шинжилгээ хийж буй байршлын ерөнхий мэдээлэл багатай байгааг харуулж байна. [29]. Цаашилбал, тэдний Италийн кластерт дэд бүтэц байгаа эсэхийг судлахын тулд Италийн генотипийг цуглуулгын бусад хэсгээс тусад нь шинжлэх нь илүү дээр байх болно. Магадгүй энэ нь эмпирик сонгон шалгаруулалтын үед газарзүйн давхаргажилт эсвэл шинж чанаруудтай холбоотой генетикийн олон янз байдлын хэв маягийг төсөөлөх боломжийг олгосон байх.
Эцэст нь хэлэхэд, энэхүү судалгаа нь орон нутгийн соёлын өвтэй холбоотой, тариаланчдын хувьд эдийн засгийн ач холбогдол бүхий сонгины газрын тухай иж бүрэн тайлан юм. Бидний үр дүнгээс харахад цөөн тооны үл хамаарах зүйлүүдийг эс тооцвол ARO нь удамшлын элэгдлийн эрсдэлээс хамгаалагдсан сайн тодорхойлогдсон удмын сантай болохыг харуулж байна. Тиймээс удамшлын олон янз байдлын энэхүү үнэ цэнэтэй эх сурвалжийн төлөөллийн цуглуулгыг бий болгох нь маш чухал юм. Эцэст нь, ARO-ийн генетик болон фенотип шинж чанар нь Европын Холбооноос чанарын тэмдэг авахад тустай байж болох юм.
Материал, арга зүй
Үр хөврөлийн цуглуулга, ургамлын материал, ДНХ-ийн ялгарал
ARO газрын 13 популяцийг Апулия мужийн төслийн хүрээнд олж авсан (BiodiverSO: https://www.biodiversitapuglia.it/), Италийн Бари мужийн Апулиан жижиг хотод "Acquaviva delle Fonti"-д гүйцэтгэсэн хэд хэдэн номлолоор дамжуулан. Бүрэлдэхүүн бүрийг цуглуулах газрыг Газарзүйн мэдээллийн системээр (GIS) зураглаж, Хүснэгтэнд тайлагнасан 4. Түүнчлэн ТРО-ын нутаг дэвсгэрийн хоёр популяци, МСБ-ын нутаг дэвсгэрийн нэг популяцийг энэхүү судалгаанд хамруулж, лавлагаа болгон ашигласан. Бүх ургамлын материалыг Баригийн их сургуулийн “П Мартуччи” туршилтын фермд (41° 1'22.08″ N, 16°54'25.95″ E) хүрээлэн буй орчны ижил нөхцөлд ургуулсан бөгөөд тэдгээрийн хооронд хөндлөн тоосжилт үүсэхээс сэргийлж хамгаалалтын торонд суулгасан. популяци болон үлээгч ялааны тусламжтайгаар популяцийн доторх тоосжилтыг баталгаажуулах (Люсилия Цезарь). 16 популяцийг булцууны хэмжээ, хэлбэр, арьс, махны өнгөтэй холбоотой шинж чанараар нь тодорхойлсон (Хүснэгт S1). Нэмж дурдахад, хатуу уусдаг бодисын агууламжийн шинжилгээг гар рефрактометр ашиглан хийж, сонгины шүүсний дээжинд 2,4-динитрофенил гидразин (0.125%) нэмсэн хурц чанарыг хэмжсэн. v/v HCl-ийн 2N-д) ба 420 нм-д шингээх чадварыг үнэлж байна. [31]. Их хэмжээний ялгаа байгаа эсэхийг тодорхойлохын тулд Duncan-ийн олон зайн тест болон SNK тестийг хийсэн.
Хүснэгт 4. Энэхүү судалгаанд цуглуулсан болон генотипчилсэн популяцийн жагсаалт. Хүн ам бүрийн хувьд таних код, нутгийн нэр, GPS-ийн координат, үрийг хадгалах генийн банк зэргийг мэдээлсэн болно.
код | нэр | GPS -ийн координат | Генийн банк y |
ARO1 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’21.708″ N 16°49’1.631” E | Di.SSPA |
ARO2 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’14.28″ N 16°48’56.879” E | Di.SSPA |
ARO3 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’11.304″ N 16°49’13.079” E | Di.SSPA |
ARO4 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’3.348″ N 16°40’27.011” E | Di.SSPA |
ARO5 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°51’59.76″ N 16°53’0.527” E | Di.SSPA |
ARO6 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’48.72″ N 16°49’43.247” E | Di.SSPA |
ARO7 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’13.47″ N 16°50’23.783” E | Di.SSPA |
ARO8 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’18.816″ N 16°49’33.888” E | Di.SSPA |
ARO9 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54"51.372″ N 16°49"3.504" E | Di.SSPA |
ARO10 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°54’1.188″ N 16°49’24.311” E | Di.SSPA |
ARO11 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52"49.8″ N 16°49"48.575" E | Di.SSPA |
ARO12 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°52’38.892″ N 16°49’28.379” E | Di.SSPA |
ARO13 | Cipolla rossa di Acquaviva | 40°53’21.768″ N 16°49’29.711” E | Di.SSPA |
TRO1 | Cipolla rossa lunga di Tropea | - | Di.SSPA |
TRO2 | Cipolla rossa tonda di Tropea | - | Di.SSPA |
MCO | Циполла рамата ди Монторо | - | Di.SSPA |
y Di.SSPA, Бари их сургуулийн Хөрс, ургамал, хүнсний шинжлэх ухааны тэнхим. |
Нэг популяцид 20 генотипийн навчны материалаас дээж авч хэрэглэх хүртэл -80°С-т хадгалсан. Полисахаридаар баялаг зүйлийн хувьд, гэх мэт A. cepa, Сайн чанарын ДНХ авахын тулд полисахаридыг зайлуулах эхний алхмууд зайлшгүй шаардлагатай тул STE буферт (0.25 М сахароз, 0.03 М Трис, 0.05 М EDTA) эхний угаалга хийж гүйцэтгэв. [52]. Нийт ДНХ-ийг CTAB аргын дагуу гаргаж авсан [53] эцэст нь Nano Drop 2000 хэт ягаан туяаны спектрофотометр (ThermoScientific, Waltham, MA, АНУ) болон 0.8% агароз гель электрофорез ашиглан чанар, концентрацийг шалгасан.
SSR шинжилгээ
EST-SSR праймерын 16 хослолыг боловсруулсан [54] ба өмнө нь генетикийн олон янз байдлын судалгаанд туршиж үзсэн [43] болон [44] ба 21 геномын SSR [45-55] тохиромжтой эсэхийг үнэлэхийн тулд шалгасан (Нэмэлт хүснэгт S4). Генотипийг эдийн засгийн флюресцент тэмдэглэгээний аргыг ашиглан гүйцэтгэсэн бөгөөд үүнд M13 сүүлийг урагш SSR праймер болгон нэмж оруулсан болно. [56]. 20 нг нийт ДНХ, 50 мМ dNTP хольц, 0.2X ПГУ-ын урвалын буфер, 1 U DreamTaq ДНХ полимераза (Thermo Scientific, Waltham, MA, АНУ), 0.8 г урвуу праймер агуулсан 0.16 гЛ урвалд ПГУ-ын хольцыг бэлтгэсэн. , M0.032 дараалалтай (13′-TGTAAAACGACGGCCAGT-5′) сунгасан 3 гМ урагш праймер ба FAM эсвэл NED флюресцент будагч бодисоор тэмдэглэсэн 0.08 гМ бүх нийтийн M13 праймер (Sigma-Aldrich, St. Louis, MO, USA). ПГУ-ын урвалыг SimpliAmp (Applied Biosystems, CA, USA) термоцикл төхөөрөмжид дийлэнх праймер хосуудад дараах нөхцлөөр гүйцэтгэсэн: 94 °C-т 5 минут, 40 цикл 94 °C-т 30 секунд, 58 °C. 45 секунд ба 72 45С-т 72 секунд, эцсийн сунгалтыг 5 446С-т 449 минутын турш хийнэ. ACM60 ба ACM55-ийн хувьд 10°C-30°C температурт 55 цикл, 5°C-т 72 цикл, дараа нь 96°C-т 14 минутын эцсийн сунгалтаар мэдрэгчтэй ПГУ-ыг ашигласан. ПГУ-ын бүтээгдэхүүнийг 0.5 цооногтой хавтанд хийж, 500 г Hi-Di Формамид (Life Technologies, Карлсбад, Калифорниа, АНУ) болон 3100 гЛ GeneScan 3.7 ROX Size Standard (Life Technologies, Карлсбад, Калифорниа, АНУ) хольсон. Ампликонуудыг ABI PRISM XNUMX Avant Genetic Analyzer (Life Technologies, Carlsbad, CA, USA) хялгасан судасны дараалал тогтоох машинаар шийдэж, GeneMapper програм хангамжийн XNUMX хувилбарыг ашиглан аллелуудыг давамгайлсан гэж оноож, хуваарилсан.
GenAlEx 6.5 программ хангамжууд [57] болон Cervus 3.0.7 [58] аллелийн тоо (Na), үр дүнтэй аллелийн тоо (Ne), ажиглагдсан гетерозигот байдал (Ho), хүлээгдэж буй гетерозигот байдал (He), полиморф мэдээллийн агуулга (PIC), Шенноны мэдээллийн индекс (I), бэхлэх индекс (Fis) зэргийг тооцоолоход ашигласан. ) SSR байршил бүрийн хувьд.
Генетикийн олон янз байдлын үнэлгээ
Сонгины популяци хоорондын болон доторх генетикийн өөрчлөлтийн шаталсан хуваалтыг GenAlEx 6.5-аар үнэлэв. [57] ач холбогдлыг шалгахын тулд 999 ачаалагчтай молекулын дисперсийн шинжилгээгээр (AMOVA). Түүнчлэн GenAlEx 6.5 программ хангамжийг бүх SSR байршлын Ho, He, Fis-ийн дундажийг тооцоолох замаар популяци бүрийн олон янз байдлыг тооцоолоход ашигласан.
Популяцийн бүтцийг STRUCTURE v.2.3.4 программ хангамжид хэрэгжүүлсэн Байесийн загварт суурилсан кластерийн алгоритмаар дүгнэсэн. [59]. Өгөгдлийн багцыг 1-ээс 10 хүртэлх тооны таамаглалын кластеруудаар (K) ажиллуулж, K утга бүрт арван бие даасан гүйлтийг тохируулсан. Үр дүнгийн нийцтэй байдлыг шалгахын тулд гүйлт бүрт 100,000 анхны шаталтын үе, 100,000 Марковын гинжин Монте Карло (MCMC) давталтуудыг хольцын загвар болон популяцийн бие даасан аллелийн давтамжийн дагуу гүйцэтгэсэн. Хамгийн их магадлалтай K утгыг тодорхойлсон АК аргыг ашиглан тодорхойлсон [60], вэбд суурилсан программ дээр БҮТЭЦ ХУРАГЧ [61]. Гишүүнчлэлийн коэффициент (q-утга) 0.7-оос их байвал тухайн хүн амыг тодорхой кластерт хуваарилж, эс бөгөөс холимог удам угсаа гэж үздэг.
Ней генетикийн зайны матрицаар илэрсэн нэгдлүүдийн хоорондын генетикийн харилцааны хэв маягийг төсөөлөхийн тулд үндсэн координатын шинжилгээг хийсэн (Нэмэлт хүснэгт S5). Аллелийн давтамж дээр үндэслэн POPTREEW програм хангамжид арифметик дундаж (UPGMA) кластерийн шинжилгээ бүхий жингүй хос бүлгийн аргыг хэрэгжүүлэн генетикийн зайны дендрограммыг бүтээв. [62]. Өгөгдлийн багцын 100 дахин загварчлалыг тохируулан шаталсан кластерчлалд итгэх итгэлийг үнэлэхийн тулд ачаалах аргыг ашигласан. Эцэст нь MEGA X програм хангамж [63] мод зурах программ болгон ашигласан.
Нэмэлт материал: Дараахь зүйлийг онлайнаар үзэх боломжтой http://www.mdpi.com/2223-7747/9/2/260/s1. Хүснэгт S1: ARO, MCO, TRO чийдэнгийн морфологийн шинж чанар. Хүснэгт S2: ARO landrace болон TRO болон MCO landrace-д тооцсон гетерозигот ба бэхэлгээний индекс. Хүснэгт S3: Fpt параметрийн хос утгууд. Хүснэгт S4: Судалгаанд ашигласан SSR-ийн жагсаалт. Хүснэгт S5. Ней генетикийн зайны хос популяцийн матриц. Зураг S1: Эванногийн Дельта К-ээр өөрчлөгдөж буй K утгуудын шугаман диаграм.
Зохиогчдын оруулсан хувь нэмэр: CL болон LR нар судалгаа хийж, туршилтыг зохион бүтээсэн; CL ба PI молекулын маркерын шинжилгээ хийсэн; ARM болон VZ хээрийн туршилт хийсэн; Өгөгдлийн шинжилгээнд RM, SP, GR, CL нар оролцсон; RM болон CL нар гар бичмэлийг бичсэн. Бүх зохиогчид гар бичмэлийн хэвлэгдсэн хувилбарыг уншиж, зөвшөөрч байна.
Санхүүжилт: Энэхүү ажлыг Апулигийн бүсийн төслөөс санхүүжүүлсэн “Апулийн хүнсний ногооны төрөл зүйлийн биологийн олон янз байдал”—Programma di Sviluppo Rurale per la Puglia 2014-2020. Мисура 10—Соттомисура 10.2; буцалтгүй тусламж CUP H92C15000270002, Итали.
Талархал: Туршилтанд ашигласан ургамлын материалаар хангасан "Azienda Agricola Iannone Anna" болон "Associazione produttori della vera cipolla rossa di Acquaviva"-д талархал илэрхийлэв.
Сонирхлын зөрчил: Зохиогчид сонирхлын зөрчилгүй гэж үздэг.
Ашигласан материал
- 1. Стерн, ВТ Аллиумын хэдэн зүйл мэддэг вэ? Кью Маг. 1992, 9, 180-182. [CrossRef]
- 2. FAOSTAT. ХХААБ-ын статистик мэдээллийн сан. Онлайнаар авах боломжтой: http://www.fao.org/2017 (8 оны 2019-р сарын XNUMX-нд хандсан).
- 3. Блок, E. Сармис, сонгины хими. Шинжлэх ухааны. Ам шүү. 1985, 252, 114-119. [CrossRef]
- 4. Ли, Б.; Юнг, JH; Ким, HS Харханд антиоксидант үйл ажиллагааны улаан сонгины үнэлгээ. Хүнсний хим. Токсикол. 2012, 50, 3912-3919. [CrossRef]
- 5. Ли, СМ; Сар, Ж.; Чун, JH; Ча, Ю.Ж.; Шин, МЖ Кверцетинээр баялаг сонгины хальсны ханд нь харханд артерийн тромбоз үүсэхэд үзүүлэх нөлөө. Хүнсний хим. Токсикол. 2013, 57, 99-105. [CrossRef] [PubMed]
- 6. Ёшинари, О.; Шиожима, Ю.; Igarashi, K. Зукер чихрийн шижинтэй өөхний харханд сонгины хандны таргалалтын эсрэг үр нөлөө. Шим тэжээлт бодис 2012, 4,1518-1526. [CrossRef]
- 7. Акаш, MSH; Рехман, К.; Chen, S. Spice ургамал Allium cepa: 2-р хэлбэрийн чихрийн шижин өвчнийг эмчлэх нэмэлт тэжээл. Тэжээл 2014, 30, 1128-1137. [CrossRef] [PubMed]
- 8. Ван Ю.; Тиан, WX; Ма, XF сонгины дарангуйлах нөлөө (Allium cepa L.) өөх тосны хүчлийн синтазыг дарангуйлах замаар хорт хавдрын эсүүд болон өөхний эсийг үржүүлэх ханд. Азийн Пак. J. Хавдар Өмнөх. 2012,13, 5573-5579. [CrossRef] [PubMed]
- 9. Лай, Дэлхийн дайн; Хусу, SC; Чуе, ФС; Чен, YY; Ян, JS; Лин, Япон; Лиен, JC; Цай, Ч.Н.; Chung, JG Quercetin нь NF-kappaB болон матриц металлопротеиназа-2/-9 дохионы замыг дарангуйлснаар хүний амны хөндийн SAS-ийн хорт хавдрын эсүүдийн шилжилт, халдлагыг дарангуйлдаг. Хорт хавдрын эсрэг Res. 2013, 33, 1941-1950. [PubMed]
- 10. Никастро, HL; Росс, SA; Milner, JA Сармис ба сонгино: Тэдний хорт хавдраас урьдчилан сэргийлэх шинж чанарууд. Хорт хавдар Өмнөх. Res. 2015, 8,181-189. [CrossRef]
- 11. Форте, Л.; Торричелли, П.; Боанини, Э.; Газзано, М.; Рубини, К.; Фини, М.; Bigi, A. Quercetin-functionalized hydroxyapatite-ийн антиоксидант ба ясны засварын шинж чанарууд: In vitro остеобласт-остеокласт-эндотелийн эсийн хамтын соёлын судалгаа. Acta Biomater. 2016, 32, 298-308. [CrossRef]
- 12. Ямазаки, Ю.; Ивасаки, К.; Миками, М.; Ягихаши, A. Allium-ийн долоон хүнсний ногоонд агуулагдах арван нэгэн амт прекурсор, S-Alk(en)yl-L-cysteine деривативын тархалт. Хүнсний шинжлэх ухаан. Технолог. Res. 2011, 17, 55-62. [CrossRef]
- 13. Блок, E. Allium төрлийн хүхрийн хүхрийн хими-Хүхрийн органик химийн үр нөлөө. Ангев. Хими. Int. Эд. Англи. 1992, 31, 1135-1178. [CrossRef]
- 14. Гриффитс, Г.; Трумэн, Л.; Кроутер, Т.; Томас, Б.; Смит, Б. Сонгино-Эрүүл мэндэд үзүүлэх дэлхийн ашиг тус. Фитотер. Res. 2002,16, 603-615. [CrossRef]
- 15. Швиммер, С.; Weston, WJ Сонгино дахь пирувийн хүчлийн ферментийн хөгжил нь хурц тод байдлын хэмжүүр юм. Ж.Агрик. Хүнсний хим. 1961, 9, 301-304. [CrossRef]
- 16. Кеттер, CAT; Randle, WM Сонгины хурц байдлын үнэлгээ. онд Лабораторийн сургалтын туршилтанд хамрагдсан судалгаа; Карчер, СЖ, Ред.; Биологийн лабораторийн боловсролын холбоо (ABLE): Нью-Йорк, Нью-Йорк, АНУ, 1998; 19-р боть, 177-196-р тал.
- 17. Ханелт, П Таксономи, хувьсал, түүх. онд Сонгино ба холбоотон үр тариа, боть. I. Ботаник, физиологи, генетик; Rabinowitch, HD, Brewster, JL, Eds.; CRC Press: Бока Ратон, Флорида, АНУ, 1990; хуудас 1-26.
- 18. Рабинович, HD; Курра, Л. Allium Crop Science: Сүүлийн үеийн дэвшил; CABI Publishing: Уоллингфорд, Их Британи, 2002 он.
- 19. Маллор, С.; Карраведо, М.; Эстопанан, Г.; Маллор, F. Сонгины генетик нөөцийн шинж чанар (Allium cepa L.) Испанийн олон янз байдлын хоёрдогч төвөөс. Хүрээ. Ж.Агрик. Res. 2011, 9, 144-155. [CrossRef]
- 20. Фериоли, Ф.; D'Antuono, LF Итали, Украины орон нутгийн сонгино, зулзаган үр хөврөл дэх фенол ба цистеины сульфоксидын үнэлгээ. Генет. Нөөц. Crop Evol. 2016, 63, 601-614. [CrossRef]
- 21. Петропулос, SA; Фернандес, А.; Баррос, Л.; Феррейра, ICFR; Ntatsi, G. Грекээс гаралтай сонгины орон нутгийн 'vatikiotiko'-ийн морфологи, тэжээллэг болон химийн тодорхойлолт. Хүнсний хим. 2015,182, 156-163. [CrossRef]
- 22. Лигуори, Л.; Адилетта, Г.; Наззаро, Ф.; Фратианни, Ф.; Ди Маттео, М.; Albanese, D. Газар дундын тэнгисийн бүс нутагт янз бүрийн сонгины сортуудын биохимийн, антиоксидант шинж чанар, нянгийн эсрэг үйл ажиллагаа. J. Хүнсний хэмжүүр. Зан чанар. 2019,13, 1232-1241. [CrossRef]
- 23. Ёо, КС; Пик, Л.; Кросби, К.; Жонс, Р.; Лесковар, D. Сорьц, өсөлтийн орчин, булцууны хэмжээ зэргээс шалтгаалж сонгины хурц байдлын ялгаа. Шинжлэх ухаан. Хортик. 2006,110, 144-149. [CrossRef]
- 24. Биск, Н.; Пернер, Х.; Шварц, Д.; Жорж, Э.; Kroh, LW; Rohn, S. Генотипийн нөлөөгөөр сонгины булцууны янз бүрийн хэсэгт quercetin-3, 4′-O-diglucoside, quercetin-4′-O-monoglucoside, quercetin-ийн тархалт (Allium cepa L.). Хүнсний хим. 2010,122, 566-571. [CrossRef]
- 25. Карузо, Г.; Конти, С.; Виллари, Г.; Боррелли, С.; Мелкионна, Г.; Минутоло, М.; Руссо, Г.; Амальфитано, С. Шилжүүлэн суулгах хугацаа, ургамлын нягтралын сонгины ургац, чанар, антиоксидант агууламжид үзүүлэх нөлөө (Allium cepa L.) Италийн өмнөд хэсэгт. Шинжлэх ухаан. Хортик. 2014,166, 111-120. [CrossRef]
- 26. Перез-Грегорио, MR; Регейро Ж.; Симал-Гандара, Ж.; Родригес, АС; Алмейда, DPF Антиоксидант флавоноидын эх үүсвэр болох сонгины нэмүү үнэ цэнийг нэмэгдүүлэх нь: Шүүмжлэлийн тойм. Шүүмжлэх. Хүнсний шинжлэх ухааны илтгэл. Nutr. 2014, 54,1050-1062. [CrossRef] [PubMed]
- 27. Понл, Т.; Швейггерт, RM; Карл, Р. Сонгины уусдаг нүүрс ус, хурц зарчимд тариалах арга ба сортын сонголтын нөлөө (Allium cepa Л.). Ж.Агрик. Хүнсний хим. 2018, 66, 12827-12835. [CrossRef] [PubMed]
- 28. Тедеско, И.; Карбон, В.; Спагнуоло, С.; Минаси, П.; Руссо, GL. Италийн өмнөд хэсгийн хоёр сортын флавоноидуудыг тодорхойлох, тоон тогтоох. allium cepa L., Tropea (улаан сонгино) ба Монторо (зэс сонгино), тэдгээрийн хүний эритроцитыг исэлдэлтийн стрессээс хамгаалах чадвар. Ж.Агрик. Хүнсний хим. 2015, 63, 5229-5238. [CrossRef]
- 29. Вильяно, С.; Эспозито, С.; Каруччи, Ф.; Фрусианте, Л.; Карпуто, Д.; Aversano, R. Сонгины өндөр бүтээмжтэй генотипчлэл нь удамшлын олон янз байдлын бүтэц, молекул үржүүлгийн хувьд ашигтай мэдээллийн SNP-ийг илрүүлдэг. Мол. Үүлдэр. 2019, 39, 5. [CrossRef]
- 30. Меркати, Ф.; Лонго, С.; Пома, Д.; Аранити, Ф.; Люпини, А.; Маммано, ММ; Фиоре, MC; Абенаволи, MR; Sunseri, F Италийн удаан хадгалагдах улаан лоолийн генетикийн өөрчлөлт (Solanum lycopersicum L.) SSR болон жимсний морфологийн шинж чанарыг ашиглан цуглуулах. Генет. Нөөц. Crop Evol. 2014, 62, 721-732. [CrossRef]
- 31. Гонзалес-Перес, С.; Маллор, С.; Гарсес-Клавер, А.; Мерино, Ф.; Табоада, А.; Ривера, А.; Помар, Ф.; Перович, Д.; Силвар, C. Сонгины цуглуулгад генетикийн олон янз байдал, чанарын шинж чанарыг судлах (Allium cepa L.) Испанийн баруун хойд нутгаас гаралтай газар нутаг. Генетик 2015, 47, 885-900. [CrossRef]
- 32. Лотти, С.; Иовьено, П.; Сентомани, И.; Маркотригиано, AR; Фанелли, В.; Мимиола, Г.; Суммо, С.; Паван, С.; Ricciardi, L. Байцааны генетик, био-агроном, тэжээллэг шинж чанар (brassica oleracea L. var. ацефала) Өмнөд Италийн Апулиа дахь олон янз байдал. Олон төрөл 2018,10, 25. [CrossRef]
- 33. Бардаро, Н.; Маркотригиано, AR; Бракуто, В.; Мацзео, Р.; Рикарди, Ф.; Лотти, С.; Паван, С.; Ricciardi, L. Эсэргүүцлийн генетикийн шинжилгээ Orobanche crenata (Forsk.) нь вандуйд (Pisum sativum L.) бага стриголактон шугам. J. Plant Pathol. 2016, 98, 671-675.
- 34. Вако, Т.; Цуказаки, Х.; Ягучи, С.; Ямашита, К.; Ито, С.; Шигёо, М. Сонгино боохдоо боолт хийх цаг хугацааны тоон шинж чанарын байршлын зураглал (Allium fistulosum Л.). Euphytica 2016, 209, 537-546. [CrossRef]
- 35. Дака, Н.; Мухопадхая, А.; Паритош, К.; Гупта, В.; Пентал, Д.; Pradhan, AK Genic SSR-ийг тодорхойлох, SSR-д суурилсан холболтын газрын зураг байгуулах Brassica juncea. Euphytica 2017, 213, 15. [CrossRef]
- 36. Анандхан, С.; Моте, SR; Gopal, J. SSR маркер ашиглан сонгины сорт шинж чанарыг үнэлэх. Үрийн шинжлэх ухаан. Технолог. 2014, 42, 279-285. [CrossRef]
- 37. Митрова, К.; Свобода, П.; Ovesna, J. БНЧУ-аас сонгины сортуудыг ялгах маркерын багцын сонголт, баталгаажуулалт. Чех Ж.Женет. Ургамлын үүлдэр. 2015, 51, 62-67. [CrossRef]
- 38. Ди Риензо, В.; Миаззи, ММ; Фанелли, В.; Сабетта, В.; Montemurro, C. Апулиан чидун үр хөврөлийн биологийн олон янз байдлын хадгалалт ба шинж чанар. Акта Хортик. 2018,1199,1-6. [CrossRef]
- 39. Маллор, С.; Арнедо-Андрес, А.; Garces-Claver, A. Испанийн генетикийн олон янз байдлыг үнэлэх allium cepa бичил хиймэл дагуулын тэмдэглэгээг ашиглан сонгино үржүүлгийн газрын . Шинжлэх ухаан. Хортик. 2014,170, 24-31. [CrossRef]
- 40. Ривера, А.; Маллор, С.; Гарсес-Клавер, А.; Гарсиа-Уллоа, А.; Помар, Ф.; Силвар, C. Сонгины генетикийн олон янз байдлыг үнэлэх нь (allium cepa L.) баруун хойд Испанийн газрын арьс ба Европын хэлбэлзэлтэй харьцуулах. NZJ Crop Hortic. 2016, 44, 103-120. [CrossRef]
- 41. Де Жованни, С.; Паван, С.; Таранто, Ф.; Ди Риензо, В.; Миаззи, ММ; Маркотригиано, AR; Мангини, Г.; Монтемурро, С.; Рикарди, Л.; Лотти, C. Ангаахайн дэлхийн үр хөврөлийн цуглуулгын генетикийн өөрчлөлт (Cicer arietinum L.) удамшлын элэгдэлд өртөх эрсдэлтэй Италийн элсэлтүүд орно. Физиол. Мол. Биол. Ургамал 2017, 23, 197-205. [CrossRef]
- 42. Мацзео, Р.; Моргез, А.; Соннанте, Г.; Зулуага, DL; Паван, С.; Рикарди, Л.; Lotti, C. Брокколи рабегийн генетикийн олон янз байдал (Брассика рапа L. subsp. силвестрис (Л.) Жанч.) Италийн өмнөд хэсгээс. Шинжлэх ухаан. Хортик. 2019, 253, 140-146. [CrossRef]
- 43. Жаксе, М.; Мартин В.; МакКаллум, Ж.; Хейви, M. Сонгины сортыг тодорхойлох нэг нуклеотидын полиморфизм, индекс, энгийн дарааллын давталт. Ж.Ам. Соц. Хортик. Шинжлэх ухаан. 2005,130, 912-917. [CrossRef]
- 44. МакКаллум, Ж.; Томсон, С.; Питер-Жойс, М.; Кенел, Ф. Удамшлын олон янз байдлын шинжилгээ ба нэг нуклеотидын полиморфизмын маркерын таримал булцууны сонгино дахь илэрхийлэл дарааллын шошго-энгийн дарааллын давталтын тэмдэглэгээнд суурилсан хөгжил. Ж.Ам. Соц. Хортик. Шинжлэх ухаан. 2008,133, 810-818. [CrossRef]
- 45. Болдуин, С.; Питер-Жойс, М.; Райт, К.; Чен, Л.; McCallum, J. Булцууны сонгины доторх болон дундах генетикийн олон янз байдлыг үнэлэх найдвартай геномын энгийн дарааллын давталтын маркеруудыг боловсруулах. (Allium cepa L.) популяци. Мол. Үүлдэр. 2012, 30, 1401-1411. [CrossRef]
- 46. ДеВуди, Жэй; Honeycutt, RL; Цагаан сүүлт буга дахь Skow, LC Microsatellite тэмдэглэгээ. Ж.Херед. 1995, 86, 317-319. [CrossRef] [PubMed]
- 47. Ходадади, М.; Хасанпанах, Д. Ираны сонгино (Allium cepa L.) ургамлуудын цус ойртолтын хямралд үзүүлэх хариу урвал. World Appl. Шинжлэх ухаан. Ж. 2010,11, 426-428.
- 48. Абду, Р.; Бакасо, Ю.; Сааду, М.; Баудойн, Япон; Харди, ОЖ Нигер сонгины генетикийн олон янз байдал (Allium cepa L.) энгийн дарааллын давталтын тэмдэглэгээгээр (SSR) үнэлнэ. Акта Хортик. 2016,1143, 77-90. [CrossRef]
- 49. Паван, С.; Лотти, С.; Маркотригиано, AR; Мацзео, Р.; Бардаро, Н.; Бракуто, В.; Рикарди, Ф.; Таранто, Ф.; Д'Агостино, Н.; Шиавулли, А.; гэх мэт. Таримал вандуй дахь өвөрмөц генетикийн кластер нь геномын хэмжээнд маркер илрүүлж, генотипийн аргаар илэрсэн. Ургамлын геном 2017, 2017,10. [CrossRef]
- 50. Паван, С.; Маркотригиано, AR; Сиани, Э.; Мацзео, Р.; Зонно, В.; Руггиери, В.; Лотти, С.; Ricciardi, L. Гуа генотипийн дараалал (Cucumis melo L.) олон янз байдлын хоёрдогч төвөөс авсан үр хөврөлийн цуглуулга нь янз бүрийн генийн сангийн генийн өөрчлөлт, геномын шинж чанарыг онцолж өгдөг. BMC Genom. 2017, 18, 59. [CrossRef]
- 51. Ди Риензо, В.; Сион, С.; Таранто, Ф.; Д'Агостино, Н.; Монтемурро, С.; Фанелли, В.; Сабетта, В.; Бушеффа, С.; Таменджари, А.; Пасквалоне, А.; гэх мэт. Газар дундын тэнгисийн сав газрын чидун жимсний популяцийн генетикийн урсгал. Үе тэнгийн Ж. 2018, 6. [CrossRef]
- 52. Хоньчин, LD; McLay, TG Полисахаридаар баялаг ургамлын эдээс ДНХ-г тусгаарлах хоёр микро масштабын протокол. J. Plant Res. 2011,124, 311-314. [CrossRef]
- 53. Дойл, Ж.Ж.; Дойл, Ж.Л. Шинэхэн эдээс ургамлын ДНХ-ийн тусгаарлалт. Фокус 1990,12, 13-14.
- 54. Кул, JC; Чеунг, Ф.; Цяопин, Ю.; Мартин В.; Зэвди, Ю.; МакКаллум, Ж.; Катанах, А.; Рутерфорд, П.; угаалтуур, KC; Жендерек, М.; гэх мэт. 11,008 сонгины илэрхийлэл бүхий дарааллын шошгоноос бүрдсэн өвөрмөц багц нь аспарагал ба монокотуудын монокотын дараалал ба геномын ялгааг харуулдаг. Ургамлын эс 2004,16, 114-125. [CrossRef]
- 55. Ким, ХЖ; Ли, хүний нөөц; Хён, Жэй; Сон, KH; Ким, KH; Ким Ж.Э; Хур, CG; Harn, SSR Finder ашиглан сонгины генетикийн цэвэр байдлын сорилтод зориулсан CH Marker хөгжүүлэлт. Солонгосын J. Breed. Шинжлэх ухаан. 2012, 44, 421-432. [CrossRef]
- 56. Schuelke, M. ПГУ-ын фрагментуудын флюресцент шошгоны эдийн засгийн арга. Нат. Биотехнол. 2000, 18, 233-234. [CrossRef] [PubMed]
- 57. Пикалл Р.; Smouse, PE GenAlEx 6.5: Excel дээрх генетикийн шинжилгээ. Сургалт, судалгааны популяцийн генетикийн програм хангамж: Шинэчлэлт. Bioinformatics 2012, 28, 2537-2539. [CrossRef] [PubMed]
- 58. Калиновски, С.Т.; Конус, ML; Маршалл, TC Компьютерийн CERVUS программ нь генотипийн алдааг хэрхэн тохируулж байгааг хянан үзэх нь эцэг тогтоох амжилтыг нэмэгдүүлдэг. Мол. Экол. 2007,16, 1099-1106. [CrossRef]
- 59. Притчард, Ж.К.; Стефенс, М.; Розенберг, НА; Donnelly, P. Бүтэцлэгдсэн популяци дахь нийгэмлэгийн зураглал. Ам. Ж.Хум. Генет. 2000, 67, 170-181. [CrossRef]
- 60. Эванно, Г.; Регнаут, С.; Goudet, J. Програм хангамж ашиглан хувь хүмүүсийн кластерын тоог илрүүлэх БҮТЭЦ: Симуляцийн судалгаа. Мол. Экол. 2005,14, 2611-2620. [CrossRef]
- 61. Эрл, Д.; VonHoldt, B. БҮТЭЦ ХАРВАСТЕР: БҮТЭЦИЙН гаралтыг дүрслэн харуулах, Эванно аргыг хэрэгжүүлэх вэб сайт болон программ. Консерв. Генет. Нөөц. 2011, 4. [CrossRef]
- 62. Такезаки, Н.; Ней, М.; Tamura, K. POPTREEW: Аллелийн давтамжийн өгөгдлөөс популяцийн модыг бий болгох, бусад хэмжигдэхүүнүүдийг тооцоолох POPTREE-ийн вэб хувилбар. Мол. Биол. Хөгжил. 2014, 31, 1622-1624. [CrossRef]
- 63. Кумар, С.; Штечер, Г.; Ли, М.; Княз, С.; Tamura, K. MEGA X. Компьютерийн платформ дээрх молекулын хувьслын генетикийн шинжилгээ. Мол. Биол. Хөгжил. 2018, 35, 1547-1549. [CrossRef]